El Repositorio de publicaciones científicas de la Pontificia Universidad del Ecuador contiene la producción intelectual de la institución. El Repositorio se encuentra organizado en tres niveles: (i) artículos en revistas científicas indexadas, (ii) libros y capítulos en libros, y (iii) memorias en eventos académicos. La Dirección de Investigación es la instancia encargada de registrar la información y actualizar el Repositorio.